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Neo4jで個人ナレッジグラフを組んだら、Notionを解約できた ― 3か月・300ファイルの実測

/ 7分で読めます / neo4j · knowledge-graph · personal-kg · notion · cypher

Notion Plusの月$10、年で$120です。3年払い続けて$360。並べて見ると、缶コーヒー1本分の判断ミスをずっと積み立てているような気分になりました。使っている機能は「ページとページをリンクで繋ぐ」だけ。データベース機能はほぼ触っていない。それでこの金額を払い続けるのは、私の中では通らなかったのです。

3か月前、私は「Notionを解約するなら、代わりの仕組みを自前で持たないと戻ってこれない」と自分に言い聞かせて、Neo4jで個人ナレッジグラフ(PKG)を組み始めました。300ファイルを取り込み、Cypherで検索できる状態にして、そして先週、実際に解約ボタンを押しました。

この記事は、その3か月分の実測記録です。RDFではなくProperty Graphを選んだ理由、AuraDB Freeの枠に収まるか、そして「取り込みで確実に詰まる3つの罠」を書きます。

Neo4j個人KGの全体像

なぜProperty Graphだったのか

最初はRDF (Resource Description Framework) で組もうとしました。「セマンティックWebで標準化されているし、正しそう」と思ったのです。ここで1週間溶かしました。

RDFは主語-述語-目的語のトリプルで世界を書き記します。厳密で美しいのですが、個人のメモ用途では厳しすぎる。「このメモに感想を追加したい」と思っただけで、reificationやRDF*の書き方をどれにするか毎回悩みました。個人の記憶は、そもそもそんなに整っていないのです。

一方Property Graphは、ノードとエッジそれぞれに任意のプロパティを直接付けられます。Neo4jが採用しているモデルです。

CREATE (n:Note {
  title: "ハーネスとエージェントの分離",
  created: date("2026-04-12"),
  tags: ["harness", "agent"],
  mood: "整理中"
})

mood: "整理中"のような、あとから思いついたプロパティを気軽に足せます。厳密性を捨てて、書き手の脳内に近い柔らかさを取りました。私がやりたかったのは「未来の自分が探せる状態にしておく」ことであって、W3Cのvocabulary審査ではなかった、というのが1週間後の結論です。

Neo4j AuraDB Freeの枠に、300ファイルは入るのか

Neo4jのマネージドサービスAuraDBのFree tierは、公式ドキュメントによると200,000ノード / 400,000リレーションシップまで無料で使えます(Neo4j AuraDB FAQ)。ただし製品ページ側では「50k/175k」表記が残っている箇所もあり、私が始めたときも表記の揺れがありました。実際に使ってみた枠は200k/400kで問題なく通ったので、以下はその前提で書きます。

私のObsidian Vaultは300ファイル、平均3,000字、内部リンク約2,800本。これをNeo4jに流し込むとどうなるか、事前に見積もりました。

要素生成される数
ノート(Note)300
タグ(Tag)ノード42
概念(Concept)ノード実測 918
LINKS_TO (Note→Note)2,800
HAS_TAG (Note→Tag)1,240
MENTIONS (Note→Concept)3,600

合計ノード ≈ 1,260、リレーションシップ ≈ 7,640。Free枠(200k/400k)に対して0.6% / 1.9%です。1,000倍まで余裕があります。Notionの容量制限を気にしなくてよくなった瞬間、体感で少し軽くなりました。

詰まった3つの罠

見積もりが甘くても実装で詰まらないとは限りません。取り込みで確実に詰まった3つを書きます。

罠1: Obsidianの内部リンクの表記揺れ

Obsidianでは[[note-name]]と書きますが、私のVaultには[[note name|表示名]]のalias付きも、[[note-name#見出し]]のアンカー付きも、![[embed-note]]の埋め込み参照も混在していました。3年分のメモは、その時々の自分の書き癖が混ざるのです。

雑な正規表現 (\[\[([^\]]+)\]\]) で吸って一気にリレーションを張ろうとしたところ、実在しないノードへのエッジが286本生まれてグラフが破綻しました。存在しないノードとのリンクは、Neo4jだと「片側だけあるエッジ」として保存されてしまうため、あとで探し出すのに丸1日かかります。

対処は、リンク解決を必ず2パスにしたことです。Pass 1でノードだけ全部作り、Pass 2でリンクを解決する。存在しないリンク先はログに落として、後日Vault側を直す。地味ですが、これで表記揺れの被害が閉じました。

罠2: 日付と時系列の統一

Obsidianの各ノートにはcreatedとmodifiedのfrontmatterがあるものと、ファイルシステムのmtimeしかないものと、YAML内で日付: 2024/04/12のようにJST表記で入っているものが混在していました。3年間で、私の日付の書き方が5回くらい変わっていたのです。

Neo4jのdate()関数はISO 8601しか受け付けません。取り込みスクリプトで統一しないまま流すと、Cypherの範囲検索が全滅します。「先月書いたメモを全部出して」が動かないPKGは、正直、価値がゼロです。

対処は、取り込み時に全メモをdate()型に強制変換し、失敗したらそのメモに:NeedsDateReviewラベルを付けて別のリストに追い出したことです。42ファイル救出しました。

罠3: 概念ノードの粒度爆発

これが3つ中で一番厄介でした。テキストから固有表現(NER)で概念ノードを作ろうとしたところ、「Claude」「Claude Code」「claude code」「Anthropic Claude Code」の4つが別ノードとして生まれました。918個の概念ノードのうち、体感で4割が同義語の重複でした。

粒度が爆発すると、グラフ全体が「点の集まり」になり、繋がりが薄くなります。せっかくグラフにしたのに、リンクが張れていない状態です。

対処は、取り込み後にaliasテーブルを1枚作って、正規化するでした。手動で200エイリアスほど整備して、Cypherで一括MERGEし直しました。918→612ノード。ここでようやく、繋がりのある地図らしくなりました。

Property Graphを設計として学ぶには、『実践ナレッジグラフ入門』の第3章と第4章に、私がこの3か月で踏んだ罠の背景理論が整理されています。Pass 1/Pass 2の話も、私は最初この本で読んで「あとで自分もこれで詰まるな」と思っていた通りに詰まりました。

解約を決めたのは、意外な瞬間だった

3か月動かして、Notionを解約したのは「Neo4jの機能が完成したから」ではありません。ある夜、MATCH (n:Note)-[:LINKS_TO*2..3]-(m:Note) WHERE n.title CONTAINS "Voice AI" RETURN m.title LIMIT 20と打ったら、2ホップ先の忘れていたメモが3件出てきたからです。

そのうちの1件は、半年前に書いた「Voice AIのlatency予算300ms」の話でした。当時、Voice AIとは別の文脈で書いていたので、Notionのバックリンク画面では絶対に辿れませんでした。Property Graphの2ホップ探索は、私の「忘れていた自分」を掘り出しました。

その瞬間に「これは月$10より価値がある」と決まり、翌日Notionを解約しました。

Neo4jにあってNotionになかったもの、逆もある

正直に書くと、Notionの方が優れている点もあります。

  • モバイルからの雑書き: NotionのiOSアプリの書き心地には勝てません。私はObsidianモバイル + iCloud syncで代替していますが、共有リンクとかチーム機能はゼロ。
  • 画像・ファイル添付: Neo4jに直接載せない設計にしたので、そこはObsidianに委ねています。
  • 表とデータベース: PropertyでもCypherでも書けますが、UIとしての快適さはNotionの圧勝。

私の判断は「個人の思考の地図が欲しくて、共同編集は要らない」だったので、この3点は諦めても解約する価値がありました。もしチームで使っているならNotion継続一択です。

まとめ

  • Notion Plus月$10を止めるためにNeo4jで個人KGを組んで、3か月後に解約できました
  • Property GraphはRDFよりも「書き手の脳内に近い柔らかさ」を許すので、個人用途では素直な選択でした
  • AuraDB Free枠(200k/400k)に対して、300ファイルは1%以下でおさまりました
  • 取り込みで詰まったのは、リンク表記揺れ / 日付統一 / 概念ノード粒度爆発の3つ
  • 「解約していい」と決まったのは、2ホップ探索で忘れていた自分のメモが出てきた瞬間でした

3年払い続けた月$10は、こうやって「毎晩Cypherを打つ楽しみ」に変わりました。缶コーヒーより、こっちの方が私の日常に馴染みます。

参考リンク: